Here is a list of all typedefs with links to the classes they belong to:

A

B

C

D

E

G

H

I

K

M

N

P

R

S

T

V

W

- a -

• annotation_t : vg::DiagramExplainer

- b -

• bin_t : vg::StreamIndexBase

- c -

• CallTable : vg::NestedFlowCaller
• candidate_id_t : vg::MultipathMapper
• chars_t : vg::algorithms::GFAParser
• clock : vg::Funnel, vg::Watchdog
• Cluster : vg::MinimizerMapper
• cluster_t : vg::MEMClusterer
• cluster_type : vg::GaplessExtender
• clustergraph_t : vg::MultipathMapper
• code_type : vg::MIPayload, vg::ZipCode
• compact_sequence_type : vg::Haplotypes
• const_iterator : vg::ShuffledPairs
• cursor_t : vg::algorithms::GFAParser, vg::StreamIndex< Message >, vg::StreamSorter< Message >

- d -

• difference_type : vg::count_back_inserter< T >, vg::VectorView< Item >::const_iterator
• duration : vg::Watchdog

- e -

• edge_ref_t : vg::DiagramExplainer
• effective_position_t : vg::Funnel
• emitter_t : vg::StreamSorter< Message >

- g -

• gen_flat_node : haplo::haplo_DP_rectangle
• gen_range_t : haplo::haplo_DP_rectangle

- h -

• hit_t : vg::MEMClusterer
• Holder : vg::subcommand::FlagArgSpec< Receiver >, vg::subcommand::RangeArgSpec< T, Receiver >

- i -

• ImmutablePath : vg::MinimizerMapper
• iterator : vg::PathIndex
• iterator_category : std::iterator_traits< vg::PhasedGenome::iterator >, std::iterator_traits< vg::ZipCodeTree::distance_iterator >, std::iterator_traits< vg::ZipCodeTree::seed_iterator >, vg::count_back_inserter< T >, vg::VectorView< Item >::const_iterator

- k -

• key_type : vg::WFAPoint
• kmer_type : vg::HaplotypePartitioner, vg::Haplotypes::Subchain, vg::ParallelKFFReader

- m -

• map_entry_type : vg::WFAPoint
• mapping_type : vg::RebuildJob
• match_fanouts_t : vg::MEMClusterer, vg::MultipathMapper
• memcluster_t : vg::MultipathMapper
• minimizer_index_type : vg::HaplotypePartitioner
• MinimizerIndex : vg::MinimizerMapper

- n -

• Node : vg::Tree< T >

- p -

• param_type : vg::discrete_distribution< T >
• path_chunk_t : vg::Surjector
• path_type : job_type, vg::PhaseUnfolder
• paths_flags_t : vg::SnarlDistanceIndexClusterer
• payload_type : vg::MinimizerMapper, vg::MIPayload, vg::ZipCode
• pointer : vg::count_back_inserter< T >, vg::VectorView< Item >::const_iterator

- r -

• reference : vg::count_back_inserter< T >, vg::VectorView< Item >::const_iterator
• result_type : vg::discrete_distribution< T >, vg::normal_distribution< T >, vg::truncated_normal_distribution< T >, vg::uniform_int_distribution< T >, vg::uniform_real_distribution< T >, vg::WideningPRNG< PRNG, OutType >

- s -

• search_type : vg::PhaseUnfolder
• Seed : vg::MinimizerMapper, vg::ZipCodeForest, vg::ZipCodeTree
• seed_type : vg::GaplessExtender, vg::GaplessExtension
• sequence_type : vg::HaplotypePartitioner, vg::Haplotypes, vg::Recombinator, vg::RecombinatorHaplotype
• state_type : vg::PhaseUnfolder
• stored_edge_t : vg::DiagramExplainer
• suggested_edge_t : vg::DiagramExplainer
• SupportMap : vg::NestedCachedPackedTraversalSupportFinder

- t -

• T : vg::subcommand::FlagArgSpec< Receiver >
• tag_list_t : vg::algorithms::GFAParser
• text_visit_iteratee_t : vg::algorithms::GFAParser
• text_visit_source_t : vg::algorithms::GFAParser
• time_point : vg::Funnel, vg::Watchdog
• tree_item_t : vg::ZipCodeForest
• tree_item_type_t : vg::ZipCodeForest
• type : vg::Range< Number >

- v -

• Value : vg::Option< vector< Item >, Parser >
• value_type : std::iterator_traits< vg::PhasedGenome::iterator >, std::iterator_traits< vg::ZipCodeTree::distance_iterator >, std::iterator_traits< vg::ZipCodeTree::seed_iterator >, vg::count_back_inserter< T >, vg::PhasedGenome::iterator, vg::SmallBitset, vg::VectorView< Item >::const_iterator, vg::WFAPoint
• Verbosity : vg::HaplotypePartitioner, vg::Recombinator
• visit_iteratee_t : vg::algorithms::GFAParser
• visit_source_t : vg::algorithms::GFAParser

- w -

• window_t : vg::StreamIndexBase